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| Registros recuperados : 1 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
14/03/2012 |
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Data da última atualização: |
14/03/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Software |
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Autoria: |
HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. C.; REGITANO, L. de A. C. |
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Afiliação: |
ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURíCIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, UFSCar; LUCIANA DE ALMEIDA CORREIA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
RPaternity. Versão 1.0. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O RPaternity implementa um método para exclusão de paternidade utilizando como marcadores polimorfismos de base única. Ele é escrito em linguagem R e pressupõe que a genotipagem foi feita por meio da plataforma Illumina Beadchip. O método implementado pode ser encontrado na referência [1] e consiste no cálculo da probabilidade de exclusão, baseado em inconsistências mendelianas entre os genótipos do suposto pai (e mãe) e filho e as frequencias alélicas verificadas na população. Considera-se nos cálculos a particular situação em que o possível pai pode ser um parente próximo do pai verdadeiro, o que constitui uma necessidade no caso de análises de dados de melhoramento animal. Dado uma população genotipada, o software permite que sejam selecionados o conjunto de marcadores mais informativos para a realização de testes de exclusão de paternidade e, a partir deste conjunto de marcadores, realizar testes em batch (lista de supostos pais x lista de filhos, todos x todos). |
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Palavras-Chave: |
Exclusão de paternidade; Polimorfismos de base única; Software. |
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Thesaurus NAL: |
Paternity; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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005 2012-03-14
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245 $aRPaternity. Versão 1.0.
260 $aCampinas: Embrapa Informática Agropecuária$c2011
300 $c1 CD-ROM.
520 $aO RPaternity implementa um método para exclusão de paternidade utilizando como marcadores polimorfismos de base única. Ele é escrito em linguagem R e pressupõe que a genotipagem foi feita por meio da plataforma Illumina Beadchip. O método implementado pode ser encontrado na referência [1] e consiste no cálculo da probabilidade de exclusão, baseado em inconsistências mendelianas entre os genótipos do suposto pai (e mãe) e filho e as frequencias alélicas verificadas na população. Considera-se nos cálculos a particular situação em que o possível pai pode ser um parente próximo do pai verdadeiro, o que constitui uma necessidade no caso de análises de dados de melhoramento animal. Dado uma população genotipada, o software permite que sejam selecionados o conjunto de marcadores mais informativos para a realização de testes de exclusão de paternidade e, a partir deste conjunto de marcadores, realizar testes em batch (lista de supostos pais x lista de filhos, todos x todos).
650 $aPaternity
650 $aSingle nucleotide polymorphism
653 $aExclusão de paternidade
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653 $aSoftware
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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